Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms