Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd5B1AYB6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms