Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NhsB1AV60 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms