Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spocd1B1ASB6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spocd1B1ASB6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms