Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms