Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms