Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms