Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scn3aA2ASI5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms