Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubb1A2AQ07 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms