Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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