Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1A2ANU3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms