Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd1A2AKB4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms