Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pramel3A2AHA7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms