Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930447F04RikA2AFR2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms