Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms