Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RlfA2A7F4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms