Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm2A2A7B5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms