Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdc27A2A6Q5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms