Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo47A2A6H3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms