Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms