Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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