Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RRN3Q9NYV6 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338.3 ms