Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KNOP1Q1ED39 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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