Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PPFIA1Q13136 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PPFIA1Q13136 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PPFIA1Q13136 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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