Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDKN3Q16667 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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