Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
IRF3Q14653 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
IRF3Q14653 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms