Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTENP60484 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTENP60484 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTENP60484 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTENP60484 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTENP60484 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTENP60484 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTENP60484 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTENP60484 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTENP60484 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTENP60484 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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