Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
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PTPRDP23468 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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PTPRDP23468 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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PTPRDP23468 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRDP23468 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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