Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNRNP35Q16560 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNRNP35Q16560 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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