Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
TCOF1Q13428 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TCOF1Q13428 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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