Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
ITGB3BPQ13352 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ITGB3BPQ13352 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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