Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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