Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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RBBP4Q09028 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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RBBP4Q09028 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
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RBBP4Q09028 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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RBBP4Q09028 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RBBP4Q09028 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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