Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SIX1Q15475 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms