Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PDE7AQ13946 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PDE7AQ13946 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms