Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RLFQ13129 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
RLFQ13129 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RLFQ13129 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RLFQ13129 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms