Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMCO1Q9UM00 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMCO1Q9UM00 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms