Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
COPS7AQ9UBW8 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms