Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
LHX9Q9NQ69 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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