Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED3Q96IU2 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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