Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC47Q96A33 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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