Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZBED9Q6R2W3 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZBED9Q6R2W3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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