Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PHYHD1Q5SRE7 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.8 ms