Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CLPPQ16740 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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