Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DDX54Q8TDD1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms