Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNRNP35Q16560 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.5 ms