Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPNMBQ14956 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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GPNMBQ14956 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPNMBQ14956 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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