Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KRR1Q13601 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
KRR1Q13601 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KRR1Q13601 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KRR1Q13601 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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