Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBBP4Q09028 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RBBP4Q09028 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms