Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VAX2Q9UIW0 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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VAX2Q9UIW0 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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